Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsdP18242 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsdP18242 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CtsdP18242 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsdP18242 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsdP18242 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsdP18242 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CtsdP18242 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CtsdP18242 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
CtsdP18242 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtsdP18242 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtsdP18242 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtsdP18242 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CtsdP18242 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms