Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ass1P16460 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ass1P16460 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ass1P16460 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ass1P16460 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ass1P16460 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ass1P16460 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ass1P16460 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ass1P16460 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ass1P16460 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ass1P16460 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ass1P16460 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ass1P16460 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ass1P16460 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ass1P16460 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ass1P16460 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ass1P16460 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ass1P16460 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ass1P16460 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ass1P16460 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ass1P16460 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ass1P16460 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ass1P16460 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ass1P16460 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ass1P16460 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ass1P16460 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ass1P16460 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ass1P16460 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ass1P16460 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ass1P16460 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ass1P16460 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ass1P16460 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ass1P16460 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms