Protein–RNA interactions for Protein: P16390

Kcna3, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna3P16390 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Kcna3P16390 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Kcna3P16390 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Kcna3P16390 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcna3P16390 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcna3P16390 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcna3P16390 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcna3P16390 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcna3P16390 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcna3P16390 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcna3P16390 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcna3P16390 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcna3P16390 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcna3P16390 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcna3P16390 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Kcna3P16390 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Kcna3P16390 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcna3P16390 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcna3P16390 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcna3P16390 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Kcna3P16390 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcna3P16390 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcna3P16390 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Kcna3P16390 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcna3P16390 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcna3P16390 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcna3P16390 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcna3P16390 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcna3P16390 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcna3P16390 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcna3P16390 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Kcna3P16390 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcna3P16390 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcna3P16390 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcna3P16390 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcna3P16390 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcna3P16390 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcna3P16390 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcna3P16390 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcna3P16390 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcna3P16390 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcna3P16390 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcna3P16390 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Kcna3P16390 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcna3P16390 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcna3P16390 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcna3P16390 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcna3P16390 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Kcna3P16390 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms