Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp53P15975 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp53P15975 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp53P15975 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp53P15975 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp53P15975 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp53P15975 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp53P15975 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp53P15975 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp53P15975 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp53P15975 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp53P15975 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp53P15975 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp53P15975 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp53P15975 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp53P15975 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp53P15975 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp53P15975 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp53P15975 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp53P15975 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp53P15975 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp53P15975 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp53P15975 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp53P15975 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp53P15975 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp53P15975 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp53P15975 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp53P15975 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp53P15975 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp53P15975 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp53P15975 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp53P15975 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp53P15975 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp53P15975 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp53P15975 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp53P15975 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp53P15975 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp53P15975 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp53P15975 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms