Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim30aP15533 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim30aP15533 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim30aP15533 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim30aP15533 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim30aP15533 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim30aP15533 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim30aP15533 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim30aP15533 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim30aP15533 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim30aP15533 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim30aP15533 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim30aP15533 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim30aP15533 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim30aP15533 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim30aP15533 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim30aP15533 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim30aP15533 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim30aP15533 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim30aP15533 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim30aP15533 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim30aP15533 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim30aP15533 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim30aP15533 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim30aP15533 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim30aP15533 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim30aP15533 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim30aP15533 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim30aP15533 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim30aP15533 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim30aP15533 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim30aP15533 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim30aP15533 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim30aP15533 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim30aP15533 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim30aP15533 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim30aP15533 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim30aP15533 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim30aP15533 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim30aP15533 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim30aP15533 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim30aP15533 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim30aP15533 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim30aP15533 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim30aP15533 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim30aP15533 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim30aP15533 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim30aP15533 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms