Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FlgP11088 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FlgP11088 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FlgP11088 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FlgP11088 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
FlgP11088 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FlgP11088 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FlgP11088 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FlgP11088 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FlgP11088 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FlgP11088 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FlgP11088 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FlgP11088 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FlgP11088 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FlgP11088 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FlgP11088 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
FlgP11088 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FlgP11088 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FlgP11088 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FlgP11088 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FlgP11088 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FlgP11088 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FlgP11088 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FlgP11088 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FlgP11088 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FlgP11088 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FlgP11088 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FlgP11088 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FlgP11088 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FlgP11088 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FlgP11088 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
FlgP11088 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FlgP11088 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
FlgP11088 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FlgP11088 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FlgP11088 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FlgP11088 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FlgP11088 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FlgP11088 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
FlgP11088 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FlgP11088 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FlgP11088 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FlgP11088 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FlgP11088 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
FlgP11088 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
FlgP11088 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FlgP11088 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FlgP11088 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FlgP11088 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FlgP11088 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
FlgP11088 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FlgP11088 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
FlgP11088 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FlgP11088 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
FlgP11088 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FlgP11088 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FlgP11088 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FlgP11088 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FlgP11088 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
FlgP11088 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FlgP11088 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FlgP11088 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FlgP11088 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FlgP11088 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FlgP11088 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FlgP11088 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FlgP11088 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FlgP11088 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FlgP11088 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
FlgP11088 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FlgP11088 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FlgP11088 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FlgP11088 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FlgP11088 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FlgP11088 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
FlgP11088 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
FlgP11088 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FlgP11088 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FlgP11088 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FlgP11088 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FlgP11088 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FlgP11088 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FlgP11088 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FlgP11088 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FlgP11088 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
FlgP11088 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
FlgP11088 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
FlgP11088 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FlgP11088 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FlgP11088 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FlgP11088 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FlgP11088 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FlgP11088 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FlgP11088 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FlgP11088 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
FlgP11088 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
FlgP11088 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FlgP11088 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FlgP11088 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
FlgP11088 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms