Protein–RNA interactions for Protein: P10922

H1f0, Histone H1.0, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H1f0P10922 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
H1f0P10922 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1f0P10922 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1f0P10922 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H1f0P10922 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1f0P10922 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1f0P10922 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1f0P10922 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H1f0P10922 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H1f0P10922 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H1f0P10922 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H1f0P10922 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H1f0P10922 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H1f0P10922 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H1f0P10922 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H1f0P10922 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H1f0P10922 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H1f0P10922 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H1f0P10922 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H1f0P10922 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H1f0P10922 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H1f0P10922 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H1f0P10922 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H1f0P10922 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H1f0P10922 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H1f0P10922 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H1f0P10922 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H1f0P10922 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H1f0P10922 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H1f0P10922 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1f0P10922 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1f0P10922 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1f0P10922 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1f0P10922 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1f0P10922 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1f0P10922 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1f0P10922 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1f0P10922 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1f0P10922 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1f0P10922 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1f0P10922 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H1f0P10922 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H1f0P10922 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1f0P10922 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H1f0P10922 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms