Protein–RNA interactions for Protein: P10855

Ccl3, C-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl3P10855 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccl3P10855 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccl3P10855 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms