Protein–RNA interactions for Protein: P0DN34

Ndufb1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb1P0DN34 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Ndufb1P0DN34 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
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