Protein–RNA interactions for Protein: P0CW02

Ly6c1, Lymphocyte antigen 6C1, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6c1P0CW02 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ly6c1P0CW02 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ly6c1P0CW02 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms