Protein–RNA interactions for Protein: P0C5K0

Sbk3, Uncharacterized serine/threonine-protein kinase SBK3, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbk3P0C5K0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sbk3P0C5K0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sbk3P0C5K0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sbk3P0C5K0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sbk3P0C5K0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sbk3P0C5K0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sbk3P0C5K0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sbk3P0C5K0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sbk3P0C5K0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sbk3P0C5K0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sbk3P0C5K0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sbk3P0C5K0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sbk3P0C5K0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sbk3P0C5K0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sbk3P0C5K0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sbk3P0C5K0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sbk3P0C5K0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sbk3P0C5K0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sbk3P0C5K0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sbk3P0C5K0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sbk3P0C5K0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sbk3P0C5K0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sbk3P0C5K0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sbk3P0C5K0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sbk3P0C5K0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sbk3P0C5K0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sbk3P0C5K0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sbk3P0C5K0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sbk3P0C5K0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sbk3P0C5K0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sbk3P0C5K0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sbk3P0C5K0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sbk3P0C5K0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sbk3P0C5K0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sbk3P0C5K0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sbk3P0C5K0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sbk3P0C5K0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sbk3P0C5K0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sbk3P0C5K0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sbk3P0C5K0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sbk3P0C5K0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sbk3P0C5K0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms