Protein–RNA interactions for Protein: P09920

Csf3, Granulocyte colony-stimulating factor, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3P09920 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf3P09920 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csf3P09920 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Csf3P09920 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3P09920 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3P09920 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3P09920 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Csf3P09920 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms