Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NeflP08551 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NeflP08551 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NeflP08551 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NeflP08551 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NeflP08551 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NeflP08551 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NeflP08551 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NeflP08551 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NeflP08551 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NeflP08551 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NeflP08551 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NeflP08551 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NeflP08551 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NeflP08551 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NeflP08551 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NeflP08551 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NeflP08551 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NeflP08551 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NeflP08551 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NeflP08551 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NeflP08551 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NeflP08551 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NeflP08551 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NeflP08551 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NeflP08551 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NeflP08551 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NeflP08551 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NeflP08551 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NeflP08551 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NeflP08551 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NeflP08551 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NeflP08551 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NeflP08551 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NeflP08551 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NeflP08551 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NeflP08551 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NeflP08551 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NeflP08551 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NeflP08551 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NeflP08551 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NeflP08551 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NeflP08551 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NeflP08551 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NeflP08551 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NeflP08551 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NeflP08551 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NeflP08551 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NeflP08551 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NeflP08551 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NeflP08551 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NeflP08551 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NeflP08551 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NeflP08551 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NeflP08551 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NeflP08551 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NeflP08551 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NeflP08551 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NeflP08551 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NeflP08551 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NeflP08551 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NeflP08551 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NeflP08551 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NeflP08551 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NeflP08551 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NeflP08551 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NeflP08551 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NeflP08551 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NeflP08551 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NeflP08551 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NeflP08551 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NeflP08551 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NeflP08551 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NeflP08551 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NeflP08551 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NeflP08551 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NeflP08551 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NeflP08551 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NeflP08551 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NeflP08551 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NeflP08551 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NeflP08551 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NeflP08551 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NeflP08551 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NeflP08551 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NeflP08551 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NeflP08551 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NeflP08551 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NeflP08551 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NeflP08551 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NeflP08551 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NeflP08551 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NeflP08551 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NeflP08551 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NeflP08551 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NeflP08551 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NeflP08551 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NeflP08551 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NeflP08551 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NeflP08551 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms