Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Me1P06801 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Me1P06801 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Me1P06801 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Me1P06801 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Me1P06801 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Me1P06801 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Me1P06801 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Me1P06801 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Me1P06801 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Me1P06801 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Me1P06801 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Me1P06801 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Me1P06801 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Me1P06801 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Me1P06801 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Me1P06801 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Me1P06801 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Me1P06801 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Me1P06801 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Me1P06801 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Me1P06801 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Me1P06801 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Me1P06801 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Me1P06801 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Me1P06801 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Me1P06801 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Me1P06801 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Me1P06801 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Me1P06801 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Me1P06801 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Me1P06801 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Me1P06801 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Me1P06801 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Me1P06801 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Me1P06801 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Me1P06801 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Me1P06801 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Me1P06801 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Me1P06801 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Me1P06801 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Me1P06801 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Me1P06801 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Me1P06801 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Me1P06801 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Me1P06801 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Me1P06801 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Me1P06801 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Me1P06801 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Me1P06801 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Me1P06801 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Me1P06801 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Me1P06801 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Me1P06801 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Me1P06801 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Me1P06801 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Me1P06801 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Me1P06801 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Me1P06801 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Me1P06801 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Me1P06801 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Me1P06801 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Me1P06801 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Me1P06801 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Me1P06801 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Me1P06801 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Me1P06801 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Me1P06801 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Me1P06801 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Me1P06801 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Me1P06801 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Me1P06801 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Me1P06801 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Me1P06801 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Me1P06801 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Me1P06801 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Me1P06801 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Me1P06801 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Me1P06801 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Me1P06801 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Me1P06801 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Me1P06801 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Me1P06801 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Me1P06801 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Me1P06801 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Me1P06801 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Me1P06801 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Me1P06801 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Me1P06801 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Me1P06801 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Me1P06801 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Me1P06801 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Me1P06801 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Me1P06801 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Me1P06801 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Me1P06801 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Me1P06801 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Me1P06801 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Me1P06801 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Me1P06801 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms