Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hoxa4P06798 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hoxa4P06798 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms