Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
P04213 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P04213 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
P04213 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
P04213 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
P04213 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
P04213 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
P04213 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
P04213 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
P04213 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
P04213 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
P04213 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
P04213 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
P04213 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
P04213 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
P04213 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
P04213 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
P04213 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
P04213 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
P04213 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
P04213 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
P04213 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
P04213 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P04213 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P04213 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P04213 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P04213 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
P04213 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P04213 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
P04213 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
P04213 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P04213 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P04213 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P04213 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P04213 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
P04213 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P04213 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
P04213 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P04213 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P04213 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
P04213 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
P04213 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
P04213 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P04213 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P04213 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P04213 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P04213 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P04213 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
P04213 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
P04213 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P04213 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P04213 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P04213 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
P04213 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P04213 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
P04213 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
P04213 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P04213 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P04213 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
P04213 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P04213 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
P04213 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P04213 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P04213 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
P04213 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P04213 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P04213 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
P04213 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P04213 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P04213 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
P04213 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
P04213 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
P04213 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
P04213 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P04213 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P04213 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
P04213 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P04213 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
P04213 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
P04213 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P04213 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P04213 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P04213 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
P04213 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
P04213 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P04213 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P04213 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P04213 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
P04213 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P04213 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
P04213 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P04213 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P04213 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P04213 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P04213 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
P04213 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
P04213 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
P04213 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
P04213 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
P04213 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms