Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Hoxa7P02830 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hoxa7P02830 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms