Protein–RNA interactions for Protein: P01822

Ig heavy chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01822 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01822 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01822 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01822 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01822 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01822 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01822 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01822 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01822 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01822 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01822 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01822 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01822 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01822 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01822 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01822 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01822 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01822 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01822 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01822 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P01822 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01822 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01822 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01822 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01822 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01822 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01822 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01822 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01822 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01822 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01822 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01822 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01822 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P01822 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01822 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01822 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01822 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01822 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01822 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01822 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P01822 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01822 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01822 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01822 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01822 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01822 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01822 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01822 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01822 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01822 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01822 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01822 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01822 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01822 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01822 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01822 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01822 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01822 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01822 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01822 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01822 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01822 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01822 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01822 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01822 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01822 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01822 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01822 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01822 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01822 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01822 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01822 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01822 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01822 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01822 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01822 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01822 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01822 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01822 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01822 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01822 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01822 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01822 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01822 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01822 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01822 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01822 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01822 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01822 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01822 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01822 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01822 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01822 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01822 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01822 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01822 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01822 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01822 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01822 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01822 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms