Protein–RNA interactions for Protein: P01804

Ig heavy chain V-III region HPC76 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01804 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01804 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01804 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01804 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01804 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01804 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01804 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01804 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01804 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01804 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01804 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01804 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01804 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01804 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01804 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01804 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01804 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01804 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01804 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01804 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01804 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P01804 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01804 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01804 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01804 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P01804 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01804 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01804 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01804 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01804 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01804 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01804 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01804 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01804 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
P01804 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01804 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01804 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01804 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01804 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01804 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01804 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01804 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01804 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01804 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01804 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01804 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01804 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01804 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01804 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01804 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01804 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01804 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01804 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01804 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01804 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01804 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01804 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01804 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01804 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01804 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01804 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01804 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01804 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01804 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01804 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01804 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01804 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01804 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01804 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01804 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01804 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01804 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01804 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01804 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01804 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01804 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01804 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01804 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01804 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01804 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01804 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01804 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01804 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01804 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01804 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01804 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01804 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01804 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01804 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01804 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01804 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01804 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01804 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01804 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01804 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01804 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01804 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01804 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01804 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01804 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms