Protein–RNA interactions for Protein: P01803

Ig heavy chain V region AMPC1, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01803 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01803 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01803 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01803 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01803 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01803 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01803 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01803 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01803 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01803 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01803 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01803 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01803 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01803 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01803 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01803 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01803 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01803 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01803 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01803 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01803 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01803 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01803 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01803 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01803 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01803 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01803 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01803 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01803 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01803 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01803 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01803 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01803 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01803 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01803 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01803 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01803 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01803 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01803 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01803 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01803 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01803 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01803 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01803 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01803 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01803 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01803 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01803 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01803 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01803 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01803 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01803 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01803 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01803 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01803 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01803 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01803 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01803 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01803 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01803 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01803 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01803 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01803 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01803 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01803 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01803 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01803 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01803 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01803 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01803 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01803 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01803 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01803 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01803 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01803 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01803 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01803 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01803 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01803 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01803 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01803 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01803 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01803 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01803 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01803 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01803 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01803 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01803 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01803 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01803 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
P01803 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01803 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01803 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01803 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01803 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01803 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01803 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01803 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01803 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01803 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms