Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01679 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01679 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01679 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01679 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01679 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01679 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01679 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01679 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01679 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01679 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01679 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01679 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
P01679 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
P01679 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01679 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01679 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
P01679 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01679 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01679 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
P01679 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01679 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01679 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01679 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01679 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01679 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01679 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01679 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01679 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01679 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01679 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01679 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01679 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01679 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01679 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
P01679 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01679 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01679 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01679 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01679 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01679 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01679 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01679 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01679 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
P01679 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01679 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01679 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01679 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01679 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01679 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01679 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01679 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01679 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01679 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01679 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01679 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01679 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
P01679 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01679 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01679 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01679 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01679 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01679 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01679 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01679 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01679 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01679 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01679 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01679 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
P01679 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01679 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01679 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
P01679 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01679 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01679 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01679 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01679 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01679 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01679 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01679 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01679 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
P01679 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01679 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01679 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
P01679 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01679 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01679 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01679 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01679 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01679 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01679 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
P01679 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01679 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01679 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01679 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01679 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01679 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01679 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01679 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01679 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms