Protein–RNA interactions for Protein: P01661

Ig kappa chain V-III region MOPC 63, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01661 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01661 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01661 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01661 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01661 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01661 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01661 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01661 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01661 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01661 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01661 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01661 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01661 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01661 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01661 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01661 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01661 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01661 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01661 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01661 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01661 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01661 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01661 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01661 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01661 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01661 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01661 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01661 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01661 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01661 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01661 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01661 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01661 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01661 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01661 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01661 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01661 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01661 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01661 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01661 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01661 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01661 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01661 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01661 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01661 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01661 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01661 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01661 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01661 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01661 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01661 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01661 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01661 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01661 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01661 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01661 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01661 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01661 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01661 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01661 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01661 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01661 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01661 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01661 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01661 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01661 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01661 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01661 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01661 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01661 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01661 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01661 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
P01661 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01661 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01661 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01661 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01661 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01661 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01661 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01661 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01661 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01661 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01661 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01661 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01661 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01661 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01661 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01661 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01661 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01661 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01661 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01661 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01661 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01661 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01661 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01661 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01661 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01661 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01661 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01661 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms