Protein–RNA interactions for Protein: P01572

Ifna1, Interferon alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna1P01572 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Ifna1P01572 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifna1P01572 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms