Protein–RNA interactions for Protein: O88851

Rbbp9, Putative hydrolase RBBP9, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp9O88851 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rbbp9O88851 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms