Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tom1O88746 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tom1O88746 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tom1O88746 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tom1O88746 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tom1O88746 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tom1O88746 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tom1O88746 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tom1O88746 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tom1O88746 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms