Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BlmO88700 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BlmO88700 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BlmO88700 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BlmO88700 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BlmO88700 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BlmO88700 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BlmO88700 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BlmO88700 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BlmO88700 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BlmO88700 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
BlmO88700 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BlmO88700 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BlmO88700 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BlmO88700 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BlmO88700 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BlmO88700 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
BlmO88700 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BlmO88700 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BlmO88700 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BlmO88700 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BlmO88700 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
BlmO88700 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
BlmO88700 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BlmO88700 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BlmO88700 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BlmO88700 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BlmO88700 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
BlmO88700 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BlmO88700 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BlmO88700 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BlmO88700 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BlmO88700 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BlmO88700 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BlmO88700 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BlmO88700 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
BlmO88700 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BlmO88700 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
BlmO88700 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
BlmO88700 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
BlmO88700 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
BlmO88700 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BlmO88700 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BlmO88700 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BlmO88700 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BlmO88700 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
BlmO88700 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BlmO88700 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
BlmO88700 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BlmO88700 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BlmO88700 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BlmO88700 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BlmO88700 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BlmO88700 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BlmO88700 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BlmO88700 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BlmO88700 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BlmO88700 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BlmO88700 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
BlmO88700 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BlmO88700 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BlmO88700 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
BlmO88700 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BlmO88700 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BlmO88700 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BlmO88700 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
BlmO88700 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BlmO88700 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BlmO88700 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BlmO88700 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BlmO88700 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BlmO88700 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
BlmO88700 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BlmO88700 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BlmO88700 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BlmO88700 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BlmO88700 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BlmO88700 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BlmO88700 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BlmO88700 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BlmO88700 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BlmO88700 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BlmO88700 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BlmO88700 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BlmO88700 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BlmO88700 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BlmO88700 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BlmO88700 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BlmO88700 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BlmO88700 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BlmO88700 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BlmO88700 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BlmO88700 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BlmO88700 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BlmO88700 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BlmO88700 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BlmO88700 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BlmO88700 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BlmO88700 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
BlmO88700 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms