Protein–RNA interactions for Protein: O88665

Brd7, Bromodomain-containing protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd7O88665 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd7O88665 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd7O88665 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Brd7O88665 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd7O88665 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd7O88665 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd7O88665 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd7O88665 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd7O88665 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Brd7O88665 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd7O88665 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms