Protein–RNA interactions for Protein: O88609

Lmx1b, LIM homeobox transcription factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1bO88609 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lmx1bO88609 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms