Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CntfrO88507 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CntfrO88507 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CntfrO88507 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CntfrO88507 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CntfrO88507 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CntfrO88507 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CntfrO88507 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CntfrO88507 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CntfrO88507 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CntfrO88507 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CntfrO88507 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntfrO88507 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntfrO88507 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CntfrO88507 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntfrO88507 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfrO88507 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfrO88507 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfrO88507 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfrO88507 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfrO88507 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfrO88507 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfrO88507 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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