Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gm10509O88255 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm10509O88255 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Gm10509O88255 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Gm10509O88255 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm10509O88255 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm10509O88255 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm10509O88255 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm10509O88255 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm10509O88255 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm10509O88255 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Gm10509O88255 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm10509O88255 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm10509O88255 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm10509O88255 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gm10509O88255 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm10509O88255 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm10509O88255 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm10509O88255 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm10509O88255 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm10509O88255 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm10509O88255 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm10509O88255 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm10509O88255 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm10509O88255 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm10509O88255 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm10509O88255 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm10509O88255 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10509O88255 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10509O88255 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10509O88255 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10509O88255 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10509O88255 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10509O88255 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10509O88255 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm10509O88255 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm10509O88255 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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