Protein–RNA interactions for Protein: O70546

Kdm6a, Lysine-specific demethylase 6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6aO70546 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm6aO70546 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm6aO70546 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm6aO70546 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm6aO70546 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm6aO70546 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm6aO70546 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm6aO70546 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm6aO70546 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm6aO70546 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm6aO70546 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm6aO70546 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Kdm6aO70546 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kdm6aO70546 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kdm6aO70546 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kdm6aO70546 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kdm6aO70546 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kdm6aO70546 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Kdm6aO70546 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm6aO70546 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm6aO70546 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm6aO70546 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm6aO70546 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm6aO70546 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm6aO70546 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm6aO70546 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm6aO70546 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm6aO70546 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm6aO70546 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm6aO70546 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm6aO70546 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm6aO70546 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm6aO70546 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm6aO70546 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm6aO70546 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm6aO70546 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm6aO70546 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm6aO70546 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm6aO70546 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm6aO70546 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms