Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SfnO70456 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SfnO70456 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SfnO70456 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SfnO70456 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SfnO70456 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SfnO70456 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SfnO70456 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SfnO70456 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SfnO70456 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SfnO70456 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SfnO70456 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SfnO70456 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SfnO70456 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SfnO70456 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SfnO70456 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SfnO70456 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SfnO70456 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SfnO70456 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SfnO70456 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SfnO70456 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SfnO70456 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SfnO70456 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SfnO70456 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SfnO70456 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SfnO70456 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SfnO70456 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SfnO70456 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SfnO70456 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SfnO70456 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SfnO70456 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SfnO70456 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SfnO70456 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SfnO70456 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SfnO70456 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SfnO70456 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SfnO70456 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SfnO70456 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SfnO70456 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SfnO70456 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SfnO70456 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SfnO70456 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SfnO70456 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SfnO70456 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SfnO70456 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SfnO70456 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SfnO70456 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SfnO70456 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SfnO70456 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SfnO70456 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SfnO70456 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SfnO70456 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SfnO70456 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SfnO70456 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SfnO70456 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SfnO70456 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SfnO70456 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SfnO70456 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SfnO70456 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SfnO70456 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SfnO70456 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SfnO70456 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SfnO70456 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SfnO70456 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SfnO70456 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SfnO70456 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SfnO70456 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SfnO70456 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SfnO70456 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SfnO70456 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SfnO70456 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SfnO70456 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SfnO70456 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SfnO70456 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SfnO70456 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SfnO70456 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
SfnO70456 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SfnO70456 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SfnO70456 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SfnO70456 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SfnO70456 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SfnO70456 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SfnO70456 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SfnO70456 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SfnO70456 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SfnO70456 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SfnO70456 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SfnO70456 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SfnO70456 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SfnO70456 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SfnO70456 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SfnO70456 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SfnO70456 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SfnO70456 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SfnO70456 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SfnO70456 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SfnO70456 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SfnO70456 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SfnO70456 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SfnO70456 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms