Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Foxq1O70220 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Foxq1O70220 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms