Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ldb2O55203 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ldb2O55203 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ldb2O55203 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ldb2O55203 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ldb2O55203 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ldb2O55203 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ldb2O55203 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ldb2O55203 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ldb2O55203 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ldb2O55203 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ldb2O55203 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ldb2O55203 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ldb2O55203 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ldb2O55203 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ldb2O55203 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ldb2O55203 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ldb2O55203 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ldb2O55203 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ldb2O55203 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ldb2O55203 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ldb2O55203 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ldb2O55203 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb2O55203 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb2O55203 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb2O55203 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb2O55203 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb2O55203 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb2O55203 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb2O55203 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb2O55203 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb2O55203 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb2O55203 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb2O55203 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb2O55203 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb2O55203 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb2O55203 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb2O55203 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ldb2O55203 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ldb2O55203 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ldb2O55203 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ldb2O55203 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms