Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Supt5hO55201 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Supt5hO55201 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms