Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cyp26a1O55127 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms