Protein–RNA interactions for Protein: O55123

Mmp10, Stromelysin-2, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp10O55123 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mmp10O55123 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mmp10O55123 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms