Protein–RNA interactions for Protein: O55047

Tlk2, Serine/threonine-protein kinase tousled-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlk2O55047 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tlk2O55047 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlk2O55047 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlk2O55047 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlk2O55047 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlk2O55047 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlk2O55047 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlk2O55047 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlk2O55047 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlk2O55047 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlk2O55047 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlk2O55047 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlk2O55047 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlk2O55047 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlk2O55047 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlk2O55047 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlk2O55047 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlk2O55047 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tlk2O55047 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlk2O55047 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlk2O55047 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlk2O55047 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlk2O55047 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlk2O55047 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlk2O55047 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlk2O55047 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlk2O55047 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlk2O55047 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlk2O55047 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlk2O55047 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlk2O55047 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tlk2O55047 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlk2O55047 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlk2O55047 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlk2O55047 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlk2O55047 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlk2O55047 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlk2O55047 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlk2O55047 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlk2O55047 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlk2O55047 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlk2O55047 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tlk2O55047 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms