Protein–RNA interactions for Protein: O55003

Bnip3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip3O55003 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Bnip3O55003 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bnip3O55003 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bnip3O55003 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bnip3O55003 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bnip3O55003 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Bnip3O55003 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bnip3O55003 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bnip3O55003 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bnip3O55003 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bnip3O55003 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bnip3O55003 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Bnip3O55003 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Bnip3O55003 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Bnip3O55003 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bnip3O55003 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bnip3O55003 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bnip3O55003 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Bnip3O55003 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bnip3O55003 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Bnip3O55003 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Bnip3O55003 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Bnip3O55003 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bnip3O55003 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bnip3O55003 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bnip3O55003 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bnip3O55003 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Bnip3O55003 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bnip3O55003 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bnip3O55003 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Bnip3O55003 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Bnip3O55003 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Bnip3O55003 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Bnip3O55003 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bnip3O55003 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bnip3O55003 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Bnip3O55003 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bnip3O55003 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Bnip3O55003 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Bnip3O55003 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Bnip3O55003 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Bnip3O55003 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bnip3O55003 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Bnip3O55003 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Bnip3O55003 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Bnip3O55003 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Bnip3O55003 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Bnip3O55003 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Bnip3O55003 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Bnip3O55003 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Bnip3O55003 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms