Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SlkO54988 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SlkO54988 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SlkO54988 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SlkO54988 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SlkO54988 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SlkO54988 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SlkO54988 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SlkO54988 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SlkO54988 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SlkO54988 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SlkO54988 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SlkO54988 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SlkO54988 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SlkO54988 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SlkO54988 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SlkO54988 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SlkO54988 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SlkO54988 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SlkO54988 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SlkO54988 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SlkO54988 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SlkO54988 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SlkO54988 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SlkO54988 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SlkO54988 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SlkO54988 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SlkO54988 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SlkO54988 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SlkO54988 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SlkO54988 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SlkO54988 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SlkO54988 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SlkO54988 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SlkO54988 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SlkO54988 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SlkO54988 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SlkO54988 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SlkO54988 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SlkO54988 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SlkO54988 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SlkO54988 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SlkO54988 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SlkO54988 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SlkO54988 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SlkO54988 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SlkO54988 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SlkO54988 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SlkO54988 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SlkO54988 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SlkO54988 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SlkO54988 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SlkO54988 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SlkO54988 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SlkO54988 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SlkO54988 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SlkO54988 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SlkO54988 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SlkO54988 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SlkO54988 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SlkO54988 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SlkO54988 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SlkO54988 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SlkO54988 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SlkO54988 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SlkO54988 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SlkO54988 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SlkO54988 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SlkO54988 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SlkO54988 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SlkO54988 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SlkO54988 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SlkO54988 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SlkO54988 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SlkO54988 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SlkO54988 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SlkO54988 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SlkO54988 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SlkO54988 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SlkO54988 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SlkO54988 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SlkO54988 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SlkO54988 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SlkO54988 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SlkO54988 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SlkO54988 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SlkO54988 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SlkO54988 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SlkO54988 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SlkO54988 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SlkO54988 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SlkO54988 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SlkO54988 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SlkO54988 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SlkO54988 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SlkO54988 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SlkO54988 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SlkO54988 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SlkO54988 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SlkO54988 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms