Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pole2O54956 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pole2O54956 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pole2O54956 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pole2O54956 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pole2O54956 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pole2O54956 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pole2O54956 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole2O54956 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole2O54956 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pole2O54956 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms