Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DffaO54786 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DffaO54786 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DffaO54786 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DffaO54786 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
DffaO54786 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DffaO54786 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DffaO54786 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DffaO54786 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DffaO54786 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DffaO54786 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DffaO54786 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DffaO54786 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DffaO54786 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DffaO54786 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DffaO54786 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DffaO54786 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DffaO54786 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DffaO54786 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DffaO54786 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DffaO54786 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DffaO54786 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DffaO54786 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DffaO54786 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DffaO54786 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DffaO54786 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DffaO54786 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DffaO54786 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DffaO54786 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DffaO54786 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DffaO54786 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DffaO54786 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DffaO54786 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DffaO54786 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DffaO54786 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DffaO54786 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DffaO54786 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DffaO54786 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DffaO54786 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DffaO54786 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DffaO54786 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DffaO54786 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DffaO54786 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DffaO54786 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DffaO54786 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DffaO54786 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DffaO54786 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DffaO54786 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DffaO54786 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DffaO54786 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DffaO54786 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DffaO54786 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DffaO54786 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DffaO54786 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DffaO54786 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DffaO54786 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DffaO54786 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DffaO54786 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DffaO54786 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DffaO54786 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DffaO54786 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DffaO54786 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DffaO54786 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DffaO54786 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DffaO54786 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
DffaO54786 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DffaO54786 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DffaO54786 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DffaO54786 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DffaO54786 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DffaO54786 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DffaO54786 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DffaO54786 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DffaO54786 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DffaO54786 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DffaO54786 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DffaO54786 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DffaO54786 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DffaO54786 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DffaO54786 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DffaO54786 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DffaO54786 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DffaO54786 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DffaO54786 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DffaO54786 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DffaO54786 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DffaO54786 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DffaO54786 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DffaO54786 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
DffaO54786 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DffaO54786 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DffaO54786 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DffaO54786 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DffaO54786 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
DffaO54786 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DffaO54786 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
DffaO54786 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DffaO54786 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DffaO54786 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
DffaO54786 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms