Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EdaO54693 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EdaO54693 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EdaO54693 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EdaO54693 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EdaO54693 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EdaO54693 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EdaO54693 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EdaO54693 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
EdaO54693 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
EdaO54693 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EdaO54693 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EdaO54693 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EdaO54693 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
EdaO54693 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EdaO54693 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EdaO54693 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EdaO54693 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EdaO54693 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EdaO54693 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EdaO54693 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
EdaO54693 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
EdaO54693 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EdaO54693 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EdaO54693 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EdaO54693 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EdaO54693 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EdaO54693 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EdaO54693 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EdaO54693 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EdaO54693 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EdaO54693 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EdaO54693 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
EdaO54693 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
EdaO54693 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
EdaO54693 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
EdaO54693 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
EdaO54693 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EdaO54693 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EdaO54693 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EdaO54693 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EdaO54693 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EdaO54693 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EdaO54693 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
EdaO54693 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EdaO54693 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EdaO54693 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EdaO54693 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EdaO54693 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
EdaO54693 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EdaO54693 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
EdaO54693 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EdaO54693 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EdaO54693 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EdaO54693 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EdaO54693 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EdaO54693 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EdaO54693 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EdaO54693 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EdaO54693 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EdaO54693 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EdaO54693 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EdaO54693 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EdaO54693 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EdaO54693 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EdaO54693 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EdaO54693 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EdaO54693 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EdaO54693 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EdaO54693 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EdaO54693 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EdaO54693 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EdaO54693 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EdaO54693 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EdaO54693 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EdaO54693 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EdaO54693 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EdaO54693 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EdaO54693 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EdaO54693 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EdaO54693 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EdaO54693 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EdaO54693 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EdaO54693 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EdaO54693 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EdaO54693 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EdaO54693 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EdaO54693 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EdaO54693 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EdaO54693 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EdaO54693 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EdaO54693 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EdaO54693 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EdaO54693 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EdaO54693 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EdaO54693 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EdaO54693 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EdaO54693 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EdaO54693 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EdaO54693 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms