Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sdc4O35988 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sdc4O35988 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms