Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pik3cdO35904 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pik3cdO35904 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms