Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Edil3O35474 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Edil3O35474 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Edil3O35474 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Edil3O35474 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Edil3O35474 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Edil3O35474 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Edil3O35474 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Edil3O35474 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Edil3O35474 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Edil3O35474 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Edil3O35474 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Edil3O35474 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Edil3O35474 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Edil3O35474 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Edil3O35474 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Edil3O35474 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Edil3O35474 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Edil3O35474 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Edil3O35474 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Edil3O35474 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Edil3O35474 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Edil3O35474 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Edil3O35474 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Edil3O35474 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Edil3O35474 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Edil3O35474 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Edil3O35474 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Edil3O35474 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Edil3O35474 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Edil3O35474 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Edil3O35474 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Edil3O35474 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Edil3O35474 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Edil3O35474 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Edil3O35474 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Edil3O35474 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Edil3O35474 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Edil3O35474 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Edil3O35474 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Edil3O35474 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms