Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TnxbO35452 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TnxbO35452 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TnxbO35452 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TnxbO35452 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TnxbO35452 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TnxbO35452 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TnxbO35452 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms