Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc1O35379 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc1O35379 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc1O35379 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc1O35379 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc1O35379 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc1O35379 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc1O35379 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Abcc1O35379 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Abcc1O35379 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Abcc1O35379 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Abcc1O35379 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Abcc1O35379 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Abcc1O35379 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Abcc1O35379 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms