Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Dgcr6O35347 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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Dgcr6O35347 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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Dgcr6O35347 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Dgcr6O35347 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Dgcr6O35347 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dgcr6O35347 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dgcr6O35347 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dgcr6O35347 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Dgcr6O35347 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Dgcr6O35347 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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Dgcr6O35347 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Dgcr6O35347 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dgcr6O35347 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Dgcr6O35347 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dgcr6O35347 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dgcr6O35347 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dgcr6O35347 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dgcr6O35347 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dgcr6O35347 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dgcr6O35347 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dgcr6O35347 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Dgcr6O35347 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dgcr6O35347 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dgcr6O35347 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dgcr6O35347 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dgcr6O35347 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dgcr6O35347 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dgcr6O35347 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Dgcr6O35347 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dgcr6O35347 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dgcr6O35347 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Dgcr6O35347 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dgcr6O35347 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms