Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kpna3O35344 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kpna3O35344 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms